MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015851	ACCC	2	8	155784	155791	25 %	0 %	0 %	75 %	340783787
3002	NC_015851	ATG	2	6	155813	155818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783787
3003	NC_015851	CCG	2	6	155854	155859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3004	NC_015851	CGT	2	6	155860	155865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3005	NC_015851	CGA	2	6	155899	155904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3006	NC_015851	CCA	2	6	156009	156014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783787
3007	NC_015851	GCAA	2	8	156031	156038	50 %	0 %	25 %	25 %	340783787
3008	NC_015851	CAA	2	6	156043	156048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783787
3009	NC_015851	GCC	2	6	156056	156061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3010	NC_015851	ATG	2	6	156099	156104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783787
3011	NC_015851	CTGC	2	8	156170	156177	0 %	25 %	25 %	50 %	340783787
3012	NC_015851	CGCGC	2	10	156291	156300	0 %	0 %	40 %	60 %	340783787
3013	NC_015851	AG	3	6	156364	156369	50 %	0 %	50 %	0 %	340783787
3014	NC_015851	CTT	2	6	156388	156393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783787
3015	NC_015851	GCTG	2	8	156394	156401	0 %	25 %	50 %	25 %	340783787
3016	NC_015851	GGCC	2	8	156425	156432	0 %	0 %	50 %	50 %	340783787
3017	NC_015851	TCA	2	6	156459	156464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3018	NC_015851	CAC	2	6	156484	156489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783787
3019	NC_015851	TAC	2	6	156608	156613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3020	NC_015851	GAC	2	6	156665	156670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3021	NC_015851	CTG	2	6	156675	156680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3022	NC_015851	TTAC	2	8	156696	156703	25 %	50 %	0 %	25 %	340783787
3023	NC_015851	CTTT	2	8	156706	156713	0 %	75 %	0 %	25 %	340783787
3024	NC_015851	GGA	2	6	156751	156756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783787
3025	NC_015851	ACC	2	6	156995	157000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783787
3026	NC_015851	GCT	2	6	157075	157080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3027	NC_015851	CGC	2	6	157105	157110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3028	NC_015851	CTG	2	6	157145	157150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3029	NC_015851	GC	3	6	157173	157178	0 %	0 %	50 %	50 %	340783787
3030	NC_015851	AAC	2	6	157209	157214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783787
3031	NC_015851	GATCA	2	10	157247	157256	40 %	20 %	20 %	20 %	340783787
3032	NC_015851	TCA	2	6	157338	157343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3033	NC_015851	CAA	2	6	157387	157392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783787
3034	NC_015851	CG	3	6	157511	157516	0 %	0 %	50 %	50 %	340783787
3035	NC_015851	CGT	2	6	157547	157552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3036	NC_015851	GCC	2	6	157646	157651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3037	NC_015851	GTG	2	6	157734	157739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783787
3038	NC_015851	GCT	2	6	157753	157758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3039	NC_015851	ATC	2	6	157908	157913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3040	NC_015851	TGG	2	6	157914	157919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783787
3041	NC_015851	GGC	2	6	157923	157928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783787
3042	NC_015851	CGA	2	6	157963	157968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3043	NC_015851	CTT	2	6	157999	158004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783787
3044	NC_015851	CGC	2	6	158105	158110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3045	NC_015851	AGC	2	6	158121	158126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3046	NC_015851	GC	3	6	158192	158197	0 %	0 %	50 %	50 %	340783787
3047	NC_015851	CCA	2	6	158220	158225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783787
3048	NC_015851	GCC	2	6	158278	158283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3049	NC_015851	CAA	2	6	158333	158338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783787
3050	NC_015851	TCA	2	6	158346	158351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3051	NC_015851	GCC	2	6	158360	158365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3052	NC_015851	TGG	2	6	158460	158465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783787
3053	NC_015851	CTG	2	6	158531	158536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3054	NC_015851	CAG	2	6	158546	158551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3055	NC_015851	TAT	2	6	158570	158575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783787
3056	NC_015851	GCGCG	2	10	158622	158631	0 %	0 %	60 %	40 %	340783787
3057	NC_015851	ATC	2	6	158633	158638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3058	NC_015851	CGCA	2	8	158768	158775	25 %	0 %	25 %	50 %	340783787
3059	NC_015851	CGAA	2	8	158824	158831	50 %	0 %	25 %	25 %	340783787
3060	NC_015851	TGC	2	6	158857	158862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3061	NC_015851	GCA	2	6	159003	159008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3062	NC_015851	CAT	2	6	159010	159015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3063	NC_015851	AGGA	2	8	159020	159027	50 %	0 %	50 %	0 %	340783787
3064	NC_015851	ATC	2	6	159099	159104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783787
3065	NC_015851	CGG	2	6	159150	159155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783787
3066	NC_015851	CAGT	2	8	159205	159212	25 %	25 %	25 %	25 %	340783787
3067	NC_015851	GCA	2	6	159240	159245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3068	NC_015851	CTG	2	6	159284	159289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3069	NC_015851	CGCCAG	2	12	159377	159388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340783787
3070	NC_015851	CGA	2	6	159472	159477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3071	NC_015851	GCTG	2	8	159481	159488	0 %	25 %	50 %	25 %	340783787
3072	NC_015851	GCC	2	6	159506	159511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
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3075	NC_015851	AGCA	2	8	159599	159606	50 %	0 %	25 %	25 %	340783787
3076	NC_015851	GAT	2	6	159608	159613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783787
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3079	NC_015851	CTTT	2	8	159737	159744	0 %	75 %	0 %	25 %	340783787
3080	NC_015851	GAA	2	6	159806	159811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783787
3081	NC_015851	TGG	2	6	159819	159824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783787
3082	NC_015851	CGA	2	6	159844	159849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783787
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3085	NC_015851	GCC	2	6	159938	159943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3086	NC_015851	GAT	2	6	159958	159963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783787
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3088	NC_015851	TCAA	2	8	160068	160075	50 %	25 %	0 %	25 %	340783787
3089	NC_015851	CGC	2	6	160097	160102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3090	NC_015851	GCT	2	6	160120	160125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3091	NC_015851	CCAG	2	8	160206	160213	25 %	0 %	25 %	50 %	340783787
3092	NC_015851	TCC	2	6	160287	160292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783787
3093	NC_015851	GCT	2	6	160298	160303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783787
3094	NC_015851	CGC	2	6	160306	160311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783787
3095	NC_015851	GGCC	2	8	160428	160435	0 %	0 %	50 %	50 %	340783787
3096	NC_015851	TCC	2	6	160505	160510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_015851	GTG	2	6	160546	160551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015851	CGC	2	6	160564	160569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_015851	GGCT	2	8	160570	160577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_015851	G	6	6	160593	160598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015851	GAC	2	6	160606	160611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_015851	CAGG	2	8	160684	160691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_015851	CTT	2	6	160820	160825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783788
3104	NC_015851	CGAT	2	8	160902	160909	25 %	25 %	25 %	25 %	340783788
3105	NC_015851	TAG	2	6	160984	160989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783788
3106	NC_015851	TCG	2	6	161031	161036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783788
3107	NC_015851	GTC	2	6	161066	161071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783788
3108	NC_015851	GAT	2	6	161072	161077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783788
3109	NC_015851	GGC	2	6	161135	161140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783788
3110	NC_015851	CGA	2	6	161254	161259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783788
3111	NC_015851	AGC	3	9	161439	161447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783788
3112	NC_015851	GC	3	6	161495	161500	0 %	0 %	50 %	50 %	340783788
3113	NC_015851	CCG	2	6	161615	161620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783789
3114	NC_015851	CTG	2	6	161650	161655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783789
3115	NC_015851	CCGTG	2	10	161673	161682	0 %	20 %	40 %	40 %	340783789
3116	NC_015851	GGGCAC	2	12	161730	161741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783789
3117	NC_015851	GCC	2	6	161744	161749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783789
3118	NC_015851	CAGGCG	2	12	161773	161784	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783789
3119	NC_015851	GAC	2	6	161842	161847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783789
3120	NC_015851	GCCTCG	2	12	161915	161926	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783789
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3122	NC_015851	GTGG	2	8	161980	161987	0 %	25 %	75 %	0 %	340783789
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3230	NC_015851	CTG	2	6	167447	167452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783793
3231	NC_015851	AGA	2	6	167488	167493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783793
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3243	NC_015851	GAAG	2	8	167939	167946	50 %	0 %	50 %	0 %	340783793
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3352	NC_015851	CTC	2	6	172675	172680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783797
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3491	NC_015851	CAC	2	6	180611	180616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783807
3492	NC_015851	GCC	2	6	180658	180663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783807
3493	NC_015851	GC	3	6	180857	180862	0 %	0 %	50 %	50 %	340783807
3494	NC_015851	TTC	3	9	180915	180923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783807
3495	NC_015851	GC	3	6	180973	180978	0 %	0 %	50 %	50 %	340783807
3496	NC_015851	GT	3	6	181045	181050	0 %	50 %	50 %	0 %	340783807
3497	NC_015851	AGC	2	6	181092	181097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783807
3498	NC_015851	CCG	2	6	181110	181115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783807
3499	NC_015851	TCG	2	6	181312	181317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783807
3500	NC_015851	GGCT	2	8	181324	181331	0 %	25 %	50 %	25 %	340783807

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